MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_6

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009789	CTG	2	6	706	711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149501
2	NC_009789	TGC	2	6	721	726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149501
3	NC_009789	T	6	6	728	733	0 %	100 %	0 %	0 %	157149501
4	NC_009789	ATG	2	6	890	895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149500
5	NC_009789	AAC	2	6	896	901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149500
6	NC_009789	CTC	2	6	3429	3434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149503
7	NC_009789	GA	3	6	3521	3526	50 %	0 %	50 %	0 %	157149503
8	NC_009789	GTC	2	6	3570	3575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149503
9	NC_009789	GGC	2	6	3603	3608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149503
10	NC_009789	CCAG	2	8	3650	3657	25 %	0 %	25 %	50 %	157149503
11	NC_009789	ATG	2	6	3673	3678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149503
12	NC_009789	ATG	2	6	3684	3689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149503
13	NC_009789	TCA	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149503
14	NC_009789	CGC	2	6	3750	3755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149503
15	NC_009789	ATC	2	6	3789	3794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149503
16	NC_009789	GC	3	6	3795	3800	0 %	0 %	50 %	50 %	157149503
17	NC_009789	GA	3	6	3941	3946	50 %	0 %	50 %	0 %	157149503
18	NC_009789	AAGGC	2	10	4242	4251	40 %	0 %	40 %	20 %	157149502
19	NC_009789	GC	3	6	4302	4307	0 %	0 %	50 %	50 %	157149502
20	NC_009789	CTG	2	6	4378	4383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149502
21	NC_009789	GCC	2	6	4390	4395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149502
22	NC_009789	CCA	2	6	4435	4440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149502
23	NC_009789	AAC	2	6	4472	4477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149502
24	NC_009789	GCG	2	6	4546	4551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149502
25	NC_009789	AAG	2	6	4572	4577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149502
26	NC_009789	TGC	2	6	4689	4694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149502
27	NC_009789	CAGA	2	8	4729	4736	50 %	0 %	25 %	25 %	157149502
28	NC_009789	GCC	2	6	4740	4745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149502
29	NC_009789	TCC	2	6	4791	4796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149502
30	NC_009789	TGA	2	6	4804	4809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149502
31	NC_009789	CGG	2	6	4878	4883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149502
32	NC_009789	CAC	2	6	4918	4923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149502
33	NC_009789	A	8	8	4988	4995	100 %	0 %	0 %	0 %	157149502
34	NC_009789	TTTC	2	8	5089	5096	0 %	75 %	0 %	25 %	157149499
35	NC_009789	GCC	2	6	5100	5105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149499
36	NC_009789	GT	3	6	5141	5146	0 %	50 %	50 %	0 %	157149499
37	NC_009789	GCG	3	9	5169	5177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149499
38	NC_009789	GC	4	8	5233	5240	0 %	0 %	50 %	50 %	157149499
39	NC_009789	ACAG	2	8	5259	5266	50 %	0 %	25 %	25 %	157149499
40	NC_009789	AGC	2	6	5336	5341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149499
41	NC_009789	A	6	6	5348	5353	100 %	0 %	0 %	0 %	157149499
42	NC_009789	GC	3	6	5417	5422	0 %	0 %	50 %	50 %	157149499
43	NC_009789	CGC	2	6	5432	5437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149499
44	NC_009789	ATG	2	6	5448	5453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149499
45	NC_009789	CTGC	2	8	5479	5486	0 %	25 %	25 %	50 %	157149499
46	NC_009789	ACG	2	6	5508	5513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149499
47	NC_009789	GAT	2	6	5523	5528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149499
48	NC_009789	CAC	2	6	5590	5595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149499
49	NC_009789	CGAG	2	8	5635	5642	25 %	0 %	50 %	25 %	157149499
50	NC_009789	CG	3	6	5688	5693	0 %	0 %	50 %	50 %	157149499
51	NC_009789	GCG	2	6	5718	5723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149499
52	NC_009789	ATG	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149499

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.